162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2854 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  928    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2317  hypothetical protein  40.3 
 
 
474 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0244932  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  36.19 
 
 
485 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  39.5 
 
 
451 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  42.82 
 
 
452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  40.05 
 
 
423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0393  hypothetical protein  37.98 
 
 
448 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.467349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4062  hypothetical protein  37.3 
 
 
435 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1586  protein of unknown function DUF815  36.76 
 
 
440 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3284  protein of unknown function DUF815  36.95 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3304  protein of unknown function DUF815  37.84 
 
 
428 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2796  protein of unknown function DUF815  37.84 
 
 
428 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0255  ATPase  37.24 
 
 
426 aa  266  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  39.04 
 
 
430 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1386  hypothetical protein  40.48 
 
 
442 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.187879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.79 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  33.11 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1700  hypothetical protein  33.12 
 
 
465 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0900  hypothetical protein  32.07 
 
 
465 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0212  hypothetical protein  32.76 
 
 
465 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1275  hypothetical protein  44.32 
 
 
438 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  43.43 
 
 
297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  42.19 
 
 
296 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3420  protein of unknown function DUF815  42.21 
 
 
429 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  39.53 
 
 
297 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2014  protein of unknown function DUF815  29.84 
 
 
392 aa  203  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  40.78 
 
 
296 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  43.2 
 
 
296 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  41.06 
 
 
292 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  41 
 
 
294 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  39.77 
 
 
289 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  40.77 
 
 
296 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  40.08 
 
 
325 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  40.38 
 
 
296 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  41.27 
 
 
296 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  43.15 
 
 
290 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  40.73 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  42.35 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  42.46 
 
 
295 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  43.15 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  39.51 
 
 
259 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  40.48 
 
 
348 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  39.23 
 
 
296 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  41.67 
 
 
299 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  40.08 
 
 
296 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  42.91 
 
 
294 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  40.65 
 
 
299 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  39.15 
 
 
294 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  41.37 
 
 
289 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  43.75 
 
 
296 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  42.91 
 
 
294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  41.67 
 
 
295 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  39.53 
 
 
297 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  38.76 
 
 
293 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  40.16 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  41.63 
 
 
291 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  40.08 
 
 
297 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  40.24 
 
 
296 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  38.49 
 
 
292 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1438  hypothetical protein  34.76 
 
 
354 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416063  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1465  protein of unknown function DUF815  40.83 
 
 
273 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000978175  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  38.4 
 
 
323 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  40.08 
 
 
294 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  38.1 
 
 
292 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  41.11 
 
 
297 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  38.4 
 
 
323 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  38.4 
 
 
323 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  38.89 
 
 
297 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1731  protein of unknown function DUF815  39.16 
 
 
357 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  38.89 
 
 
297 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  39.68 
 
 
289 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  39.68 
 
 
289 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0715  ABC transporter ATPase  42.5 
 
 
254 aa  177  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0689546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  40.89 
 
 
298 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  40.24 
 
 
296 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  39.68 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  40.24 
 
 
289 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  39.29 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  39.29 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  38.8 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  40.08 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  39.2 
 
 
291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  39.76 
 
 
284 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  39.29 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  39.29 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  39.29 
 
 
289 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  38.49 
 
 
318 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  38.96 
 
 
299 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  37.97 
 
 
292 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>