162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1465 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1465  protein of unknown function DUF815  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000978175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  38.75 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  38.43 
 
 
296 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  38.93 
 
 
290 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  40.09 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  39.42 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  36.9 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  38.49 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  35.97 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  38.59 
 
 
279 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  37.96 
 
 
296 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  38.59 
 
 
279 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  38.65 
 
 
287 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  36.69 
 
 
325 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  36.81 
 
 
292 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  39.33 
 
 
430 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  35.06 
 
 
278 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  38.14 
 
 
296 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  35.74 
 
 
296 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  39.09 
 
 
335 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  37.9 
 
 
320 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1183  hypothetical protein  37.65 
 
 
289 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  36.58 
 
 
304 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  37.55 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  35.38 
 
 
296 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  39.59 
 
 
296 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  35.78 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  39.2 
 
 
296 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  38.55 
 
 
306 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  40.08 
 
 
300 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  38.8 
 
 
291 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  35.4 
 
 
289 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  36.7 
 
 
290 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  34.69 
 
 
291 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  40.83 
 
 
295 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  37.23 
 
 
288 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  37.9 
 
 
323 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  37.23 
 
 
288 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  34.32 
 
 
293 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  37.19 
 
 
291 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  33.33 
 
 
303 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  39.67 
 
 
294 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  39.41 
 
 
296 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  36.23 
 
 
296 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  38.27 
 
 
296 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  38.4 
 
 
295 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  38.82 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  38.4 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  38.72 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  37.39 
 
 
348 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  37.13 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  37.94 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  39.83 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  40.85 
 
 
288 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  37.39 
 
 
295 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  36.29 
 
 
324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3284  protein of unknown function DUF815  42.86 
 
 
459 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  38.3 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  35.38 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  35.46 
 
 
284 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  39.82 
 
 
287 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  35.19 
 
 
280 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  33.82 
 
 
293 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  39.82 
 
 
287 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  33.58 
 
 
296 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  39.59 
 
 
288 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0357  protein of unknown function DUF815  41.74 
 
 
251 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0894135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  35.48 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  38.4 
 
 
436 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  37.19 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  37.55 
 
 
451 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  39 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  33.45 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  34.19 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  33.46 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  38.46 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  38.59 
 
 
297 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  35.13 
 
 
297 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  34.18 
 
 
290 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  33.46 
 
 
292 aa  178  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  35.16 
 
 
310 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  40.83 
 
 
447 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  39.22 
 
 
290 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  38.79 
 
 
290 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  39.48 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  36.29 
 
 
291 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  38.72 
 
 
259 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  33.21 
 
 
318 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  39.91 
 
 
289 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  37.35 
 
 
307 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  34.96 
 
 
291 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  40.91 
 
 
296 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  39.06 
 
 
289 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>