54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0540 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  100 
 
 		 407 aa  828    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  37.19 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  36.93 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  36.93 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  34.88 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  36.93 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  37.89 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  31.77 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.35 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  37.04 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  27.53 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  27.76 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  31.83 
 
 		 395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.59 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  30.79 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.13 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  35.43 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.51 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.9 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  28.45 
 
 		 519 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  26.13 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  28.98 
 
 		 398 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  27.13 
 
 		 555 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  23.99 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  27.46 
 
 		 575 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  32.16 
 
 		 549 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  26.21 
 
 		 328 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.82 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.82 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.82 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49480  predicted protein  28.71 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1604  taurine catabolism dioxygenase TauD  25.69 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1521  taurine catabolism dioxygenase TauD  25.69 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0099  hypothetical protein  25.69 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0650  hypothetical protein  29.38 
 
 		 301 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  23.42 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  23.42 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  23.42 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  23.42 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  23.42 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  23.42 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  23.42 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  29.19 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3224  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.23 
 
 		 284 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1283  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.85 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2184  taurine catabolism dioxygenase  27.44 
 
 		 314 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.415613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.39 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  22.73 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1104  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.59 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  25.6 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2986  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  25.36 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.71 
 
 		 287 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  27.16 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2491  hypothetical protein  24.73 
 
 		 301 aa  43.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.876184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>