46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0230 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  88.96 
 
 
299 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  88.96 
 
 
299 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  88.96 
 
 
299 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  88.96 
 
 
299 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  90.41 
 
 
304 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  90.07 
 
 
304 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  89.73 
 
 
304 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2908  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  63.19 
 
 
292 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2986  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  60.34 
 
 
291 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35420  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  60.34 
 
 
291 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00595463  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0237  hypothetical protein  48.48 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0237  hypothetical protein  48.86 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1534  PvcB protein  49.06 
 
 
287 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.77 
 
 
287 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3224  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  47.39 
 
 
284 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1104  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.63 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2755  pyoverdine biosynthesis protein  34.9 
 
 
270 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  27.24 
 
 
587 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  23.94 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  22.8 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  22.69 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  26.89 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  24.1 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  24.09 
 
 
555 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.24 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.87 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  23.94 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.89 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.49 
 
 
282 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1748  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.79 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.11 
 
 
431 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  22.19 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  22.5 
 
 
575 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  23.74 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  27.21 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.73 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  23.97 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  26.15 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  25.22 
 
 
398 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0370  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.21 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.11 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  24.77 
 
 
424 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  23.53 
 
 
371 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  26.7 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  20.94 
 
 
285 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>