68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0237 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0237  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0237  hypothetical protein  99.28 
 
 
278 aa  577  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1534  PvcB protein  65.11 
 
 
287 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  49.06 
 
 
299 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  49.06 
 
 
299 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  49.06 
 
 
299 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  49.06 
 
 
299 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  49.06 
 
 
304 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  49.06 
 
 
304 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  49.62 
 
 
304 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35420  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  49.06 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00595463  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  48.86 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2986  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  48.68 
 
 
291 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2908  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.56 
 
 
292 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.13 
 
 
287 aa  268  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3224  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.1 
 
 
284 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1104  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.53 
 
 
279 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2755  pyoverdine biosynthesis protein  35.91 
 
 
270 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  26.42 
 
 
587 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  24.3 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  20.89 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  20.55 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  25.49 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  26.54 
 
 
316 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  20.64 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2092  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.05 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.231505  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  28.44 
 
 
398 aa  52.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  25.3 
 
 
264 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  24.87 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1748  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.52 
 
 
382 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  21.4 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  22.41 
 
 
319 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.52 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.52 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  22.65 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  22.55 
 
 
555 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  23.02 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  23.92 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  22.17 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  21.5 
 
 
575 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  24.71 
 
 
267 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  23.44 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  21.72 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.71 
 
 
281 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  23.46 
 
 
306 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  24.38 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  26.04 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  24 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  22.17 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  22.86 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08579  conserved hypothetical protein  25.16 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.83 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  24.75 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.91 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  24 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  22.62 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05350  conserved hypothetical protein  21.02 
 
 
375 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  24.08 
 
 
301 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  21.83 
 
 
424 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  23.56 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0370  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.35 
 
 
325 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  23.28 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  21.38 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  25.5 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  22.93 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.16 
 
 
294 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>