47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0333 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  100 
 
 		 382 aa  788    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  37.19 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.01 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  33.43 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.45 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  35.28 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  32.69 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  31.18 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  30.11 
 
 		 400 aa  176  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.39 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  32.39 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  32.11 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.91 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.12 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  31.22 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  30.42 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  31.49 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  27.09 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  27.09 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  29.68 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  26.78 
 
 		 519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  23 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  24.17 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  27.35 
 
 		 555 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  26.43 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.32 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.32 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  31.16 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.32 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.2 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49480  predicted protein  29.75 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  24.21 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  24.21 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  24.21 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  24.21 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  23.72 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  24.21 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  23.72 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1989  hypothetical protein  28.3 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2184  taurine catabolism dioxygenase  27.88 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.415613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2491  hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.876184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0237  hypothetical protein  21.31 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0237  hypothetical protein  21.72 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1058  hypothetical protein  26.6 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  19.37 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0650  hypothetical protein  26.47 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  22.11 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>