36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3320 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  91.65 
 
 		 398 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  98.75 
 
 		 403 aa  789    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  100 
 
 		 401 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  94.68 
 
 		 398 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  93.67 
 
 		 398 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  100 
 
 		 401 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  58.82 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  58.06 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.31 
 
 		 431 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  39.76 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  39.85 
 
 		 402 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  39.29 
 
 		 424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.79 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  36.93 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  26.85 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  32.6 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  27.99 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.77 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.07 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  29.65 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  29.84 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  24.53 
 
 		 453 aa  133  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  25.63 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  30.11 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.84 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.84 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  26.69 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  28.61 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.57 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  32.68 
 
 		 549 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49480  predicted protein  24.43 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  30.16 
 
 		 144 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.5 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  27.27 
 
 		 111 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>