29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0693 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  100 
 
 		 328 aa  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.39 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.57 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.57 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.57 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.4 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.96 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.46 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  27.63 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.81 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.81 
 
 		 398 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  26.21 
 
 		 407 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.53 
 
 		 431 aa  86.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.26 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  27.82 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.2 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  26.33 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  24.15 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  24.69 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  21.89 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  24.28 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  22.78 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  23.56 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  25.98 
 
 		 575 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  24.05 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  22.34 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.9 
 
 		 382 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.9 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.9 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>