34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02980 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  100 
 
 		 447 aa  936    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  41.84 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  36.81 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  31.81 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  31 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  30.19 
 
 		 387 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  30.79 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  26.98 
 
 		 555 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.48 
 
 		 402 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  27.22 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  26.22 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  28.29 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  26.94 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  26.94 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.06 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  27.22 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  27.78 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  26.67 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.07 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  22.73 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  25.82 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  24.17 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  24.17 
 
 		 575 aa  94  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.59 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  24.59 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.89 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.89 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.89 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49480  predicted protein  31.44 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  24.72 
 
 		 549 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  21.89 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0237  hypothetical protein  21.96 
 
 		 278 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1283  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.03 
 
 		 250 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>