35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5234 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  100 
 
 		 387 aa  794    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  70.21 
 
 		 395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  58.31 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  58.06 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  58.06 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  57.18 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  57.96 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  57.96 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  40.1 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  40.98 
 
 		 402 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.2 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  40.58 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  34.2 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  33.43 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  28.5 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  31.25 
 
 		 371 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  31.77 
 
 		 407 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  30.41 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  31.73 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.69 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  30.19 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  28.06 
 
 		 519 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  30.08 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.81 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.81 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  26.12 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  25.88 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  25.8 
 
 		 575 aa  97.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  29.52 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49480  predicted protein  26.09 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  24.15 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.08 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  31.34 
 
 		 111 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  31.34 
 
 		 111 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>