81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0704 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 287 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3224  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  74.2 
 
 		 284 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1104  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  75.18 
 
 		 279 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0237  hypothetical protein  45.13 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0237  hypothetical protein  45.13 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35420  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  49.06 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00595463  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2986  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  48.31 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1534  PvcB protein  43.62 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  46.82 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  46.82 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  46.82 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  46.82 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  46.82 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  46.82 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  46.82 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  46.44 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2908  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.11 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2755  pyoverdine biosynthesis protein  39.61 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  30.23 
 
 		 587 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  24.37 
 
 		 661 aa  82.4  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  24.22 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  27.37 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  27.37 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.65 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0370  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.13 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  26.03 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  23.15 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.55 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  25.59 
 
 		 424 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  33.33 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.97 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2092  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.96 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.231505  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.11 
 
 		 382 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.11 
 
 		 382 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  30.65 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  24.47 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  26.29 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.21 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  25.1 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  32.47 
 
 		 555 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.52 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  24.2 
 
 		 549 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  21.5 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  25.94 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  25.44 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  27.62 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  27.62 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.46 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  22.18 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  24.48 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  25.56 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.88 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.03 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  25.38 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  25.56 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  25.56 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  23.08 
 
 		 387 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  25.91 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  26.13 
 
 		 398 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.07 
 
 		 431 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  25 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  24.74 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1748  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.93 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0211  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.91 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  21.86 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  25.37 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  19.37 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.41 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  27.23 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  21.92 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34422  predicted protein  24.84 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.516584  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  24.37 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  23.95 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.37 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  22.71 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  26.7 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  24.54 
 
 		 519 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5179  hypothetical protein  22.62 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  26.49 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>