262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2614 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  100 
 
 		 279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  89.21 
 
 		 279 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.8 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.73 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.07 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.07 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.43 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.64 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.64 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.64 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.67 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.63 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.42 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.69 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.06 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.34 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.93 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.31 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  33.7 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.73 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.66 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.95 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.95 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.95 
 
 		 305 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  31.91 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.94 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.07 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  34.39 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.35 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  32.05 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  31.66 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  31.66 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  31.73 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  30.56 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.42 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.73 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  32.16 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  32.16 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  32.16 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  32.16 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  32.16 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  32.16 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  30.5 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2092  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.16 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.231505  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  28.87 
 
 		 308 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  27.86 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  28.52 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.9 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  28.83 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.36 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  30.61 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  31.75 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  29.27 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  29.21 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  26.57 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  28.46 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.09 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.48 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  30.5 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  28.46 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  26.76 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  27.15 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  27.76 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  29.92 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  29.01 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  31.91 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  27.65 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  28.1 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  29.18 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  29.43 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  29.18 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  29.51 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  29.08 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  29.51 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  29.89 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  28.84 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  27.01 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  29.2 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  31.01 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  26.41 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.92 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  27.38 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  28.62 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  27.17 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  29.57 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.86 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  29.12 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.8 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  29.57 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  29.57 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  28.52 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  28.16 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  28.72 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  28.87 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  28.03 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4317  taurine catabolism dioxygenase  27.27 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  28.27 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  28.4 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  25.89 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  26.95 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>