272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6479 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 287 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.33 
 
 		 305 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.33 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  61.7 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.33 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  47.35 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  40.7 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  44.06 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  40 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  41.75 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  37.77 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  37.14 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  37.28 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.55 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  39.01 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  37.72 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  35.79 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  35.79 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.53 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  36.84 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  33.11 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  38.57 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  36.62 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  34.8 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  34.52 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  33.7 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  33.57 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  32.51 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  35.11 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.51 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  35.23 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  33.45 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.76 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.13 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  33.22 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  33.57 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  34.62 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  35.71 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  35.74 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  32.38 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.16 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  32.99 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  33.33 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.71 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  32.64 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  31.34 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  34.51 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  34.51 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  31.34 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  34.81 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  35.4 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  30.99 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  36.08 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  34.95 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  31.29 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.02 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  34.47 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.49 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  34.15 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  34.14 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  34.74 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  34.81 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  33.9 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  32.64 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  32.87 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  33.46 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  33.45 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.08 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.08 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.08 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.76 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.41 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  30.24 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.46 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.96 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.46 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  31.85 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  31.85 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  31.85 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  28.77 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  31.3 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.83 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  33.09 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  30.3 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.6 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.07 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  30.88 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  28.08 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  30.88 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  30.88 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>