271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2155 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  65.55 
 
 
299 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  65.87 
 
 
301 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  61.72 
 
 
298 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  42.4 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.7 
 
 
287 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.94 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.28 
 
 
305 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.28 
 
 
305 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.93 
 
 
305 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  35.36 
 
 
302 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  35.36 
 
 
304 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  35.86 
 
 
273 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  35 
 
 
302 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  35.94 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  33.56 
 
 
308 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  34.36 
 
 
299 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  34.64 
 
 
308 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  34.64 
 
 
308 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  34.36 
 
 
299 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  33.68 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  34.29 
 
 
308 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  34.29 
 
 
308 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  34.04 
 
 
295 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  32.88 
 
 
285 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  34.16 
 
 
299 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  34.29 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  33.93 
 
 
308 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.98 
 
 
298 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  32.37 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  32.88 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  30.29 
 
 
312 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  31.65 
 
 
298 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  32.16 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.92 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.85 
 
 
277 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  31.65 
 
 
277 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  30.25 
 
 
301 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  30.3 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.1 
 
 
278 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  30.51 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  31.31 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  29.97 
 
 
277 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  30.51 
 
 
291 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  28.83 
 
 
300 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.77 
 
 
287 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.8 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.72 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  28.47 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  29.72 
 
 
280 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  29.11 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  28.77 
 
 
299 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  32.14 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.43 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.85 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.62 
 
 
277 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  29.29 
 
 
315 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.5 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.79 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.45 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  28.67 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  28.37 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  27.37 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  28.87 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  29.57 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.85 
 
 
281 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  27.4 
 
 
314 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  28.47 
 
 
276 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.2 
 
 
268 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  29.33 
 
 
315 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  28.87 
 
 
318 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  29.37 
 
 
289 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  28.28 
 
 
282 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.94 
 
 
288 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  29.05 
 
 
277 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.98 
 
 
279 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  29.05 
 
 
335 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  29.05 
 
 
277 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  29.59 
 
 
270 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  26.26 
 
 
283 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  27.37 
 
 
315 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  28.57 
 
 
315 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  27.54 
 
 
282 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  28.27 
 
 
292 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  28.42 
 
 
315 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  27.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  27.92 
 
 
315 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>