272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2472 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  82.92 
 
 
281 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  82.56 
 
 
281 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  82.56 
 
 
281 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  80.43 
 
 
281 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.86 
 
 
281 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.83 
 
 
281 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  59.79 
 
 
276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.29 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.53 
 
 
275 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.74 
 
 
268 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.18 
 
 
277 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.53 
 
 
277 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.73 
 
 
278 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.52 
 
 
278 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  47.5 
 
 
279 aa  228  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  41.07 
 
 
279 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.43 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  37.37 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.49 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  34.46 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  33.78 
 
 
295 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  34.28 
 
 
301 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  34.88 
 
 
305 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  33.22 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.34 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  32.99 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  34.6 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  33.68 
 
 
300 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.14 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.14 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  30.87 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  31.58 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.45 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  33.1 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  30.63 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  32.29 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2092  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.07 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.231505  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  34.26 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  31.1 
 
 
298 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  31.72 
 
 
299 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  31.51 
 
 
282 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.21 
 
 
294 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  34.26 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  31.16 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  29.35 
 
 
298 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  33.91 
 
 
277 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  31.96 
 
 
302 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  32.98 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  30.14 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.31 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  32.88 
 
 
281 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  30.85 
 
 
301 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.85 
 
 
288 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  29.11 
 
 
299 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  31.51 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.19 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  28.77 
 
 
299 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
291 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  31.31 
 
 
299 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  31.34 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  31.38 
 
 
299 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  31.31 
 
 
299 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  32.07 
 
 
295 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  31.85 
 
 
306 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  29.58 
 
 
281 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  32.04 
 
 
267 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  31.27 
 
 
282 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  32.04 
 
 
264 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  30.03 
 
 
303 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  31.38 
 
 
306 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.49 
 
 
304 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  31.51 
 
 
282 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  31.86 
 
 
276 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
277 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  28.62 
 
 
299 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.34 
 
 
270 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
335 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  30.96 
 
 
304 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
308 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
308 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  31.6 
 
 
282 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  29.62 
 
 
277 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.16 
 
 
282 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  29.79 
 
 
301 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  30.85 
 
 
281 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  30.85 
 
 
281 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  28.62 
 
 
299 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  31.94 
 
 
277 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  33.57 
 
 
309 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  31.6 
 
 
282 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  29.86 
 
 
278 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  30.41 
 
 
304 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.18 
 
 
284 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  30 
 
 
290 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  31.38 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>