269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3374 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  81.14 
 
 
281 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.27 
 
 
281 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.27 
 
 
281 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.27 
 
 
281 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.27 
 
 
281 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.83 
 
 
281 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.25 
 
 
276 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.47 
 
 
279 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.18 
 
 
275 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.38 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.4 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.36 
 
 
278 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  47.5 
 
 
279 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.07 
 
 
277 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.04 
 
 
277 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  38.63 
 
 
279 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.18 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  34.15 
 
 
296 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.76 
 
 
287 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  34.83 
 
 
299 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  31.53 
 
 
295 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.88 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.88 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.88 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  33.1 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.38 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  31.72 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  32.39 
 
 
301 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.24 
 
 
305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  31.4 
 
 
304 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  30.74 
 
 
287 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  32.53 
 
 
312 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  32.76 
 
 
300 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  30.53 
 
 
327 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  30.53 
 
 
327 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  30.07 
 
 
299 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.47 
 
 
321 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  29.58 
 
 
281 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  30.28 
 
 
327 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.72 
 
 
293 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.59 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  29.59 
 
 
299 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  30.66 
 
 
291 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  32.4 
 
 
301 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  30.99 
 
 
301 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  29.59 
 
 
299 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  31.8 
 
 
309 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.25 
 
 
288 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  31.72 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  31.69 
 
 
301 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  28.57 
 
 
299 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  30.21 
 
 
305 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
317 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  28.47 
 
 
285 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  27.53 
 
 
283 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  31.01 
 
 
264 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  29.03 
 
 
300 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  31.72 
 
 
306 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  27.53 
 
 
283 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  31.38 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  31.38 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  31.38 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  30.45 
 
 
308 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  27.78 
 
 
280 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  30.36 
 
 
300 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  31.38 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  31.38 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  29.79 
 
 
273 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  30.45 
 
 
308 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  29.93 
 
 
302 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  30.39 
 
 
277 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  31.88 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  29.11 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  29.87 
 
 
302 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  30.07 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  30.58 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  27.3 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  31.12 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  29.93 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  30 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  27.78 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  28.04 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  27.55 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  30 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  30.48 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  30.39 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  28.62 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  28.22 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  28.52 
 
 
318 aa  95.5  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  30.18 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  27.99 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>