272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6225 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  97.7 
 
 
305 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  97.7 
 
 
305 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.33 
 
 
287 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.69 
 
 
293 aa  341  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  44.56 
 
 
295 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  42.86 
 
 
301 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  39.93 
 
 
301 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  38.57 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  41.58 
 
 
298 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  33.67 
 
 
312 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  35.77 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  37.09 
 
 
299 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  33.21 
 
 
287 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  35.04 
 
 
302 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  34.67 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.19 
 
 
298 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  34.93 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  35.27 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  33.56 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  32.88 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  32.88 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
308 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  34.36 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  33.11 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  33.09 
 
 
299 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  35.32 
 
 
272 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  34.13 
 
 
273 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.7 
 
 
287 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  32.49 
 
 
305 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  32.54 
 
 
299 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.05 
 
 
278 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  30.97 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  32.61 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  31.96 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.75 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  32.25 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  31 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  30.74 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.8 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  30.97 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  33.21 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  31.58 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  33.45 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.49 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  32.14 
 
 
335 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  32.14 
 
 
277 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.05 
 
 
284 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  29.11 
 
 
264 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.45 
 
 
278 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  29.26 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  28.77 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.7 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.45 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  28.77 
 
 
271 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  31.79 
 
 
277 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  32.65 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  32.65 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  30.34 
 
 
293 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  32.19 
 
 
277 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  32.09 
 
 
315 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  31.85 
 
 
277 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  31.85 
 
 
277 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  29.35 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  31.94 
 
 
304 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  29.04 
 
 
285 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.24 
 
 
281 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.8 
 
 
279 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
270 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  30.86 
 
 
299 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.63 
 
 
288 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  32.95 
 
 
279 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  32.86 
 
 
322 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.35 
 
 
281 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.35 
 
 
281 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  31.51 
 
 
291 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.35 
 
 
281 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  30.48 
 
 
299 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  28.97 
 
 
315 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  31.72 
 
 
289 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  32.23 
 
 
318 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.08 
 
 
276 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.97 
 
 
277 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  28.88 
 
 
301 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  30.64 
 
 
278 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.09 
 
 
281 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  28.62 
 
 
315 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.33 
 
 
277 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.2 
 
 
268 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  28.31 
 
 
281 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.05 
 
 
304 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  30.04 
 
 
303 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  29.29 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  30.55 
 
 
297 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  29.29 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  29.29 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  30.55 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  30.55 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>