275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7105 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  76.26 
 
 		 278 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.86 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  65.23 
 
 		 277 aa  358  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.63 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.92 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.85 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.19 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.52 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.36 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.24 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.24 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.24 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.8 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.36 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.31 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  37.31 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.25 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  35.44 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.13 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  34.4 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  31.49 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.78 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.4 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.4 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  31.8 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.05 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  30.47 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.72 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  32.16 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  31.13 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  30.72 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  29.79 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  30.28 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.42 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  31.91 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.42 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.38 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  31.29 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  31.29 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  30.82 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  30 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  31.5 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  29.75 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  30.48 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  29.54 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  30.94 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  30 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  29.54 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  31.12 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  29.54 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  29.33 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.68 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  31.21 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  29.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  29.39 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  29.64 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  32.03 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.56 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  30.93 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  31.27 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  29.64 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  31.91 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  30.58 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.58 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  29.64 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  30.88 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  31.05 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  30.24 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  29.96 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  30.28 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  30.32 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  27.78 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  28.78 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  27.78 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  30.14 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  28.67 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  27.78 
 
 		 327 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  29.6 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  27.56 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  29.58 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  30.25 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  28.15 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  30.25 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  30.25 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  28.52 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  30 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  30.03 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.038749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>