277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6916 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  60.43 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  58.93 
 
 		 278 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.63 
 
 		 278 aa  308  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  55.4 
 
 		 279 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.18 
 
 		 281 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.79 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  47.08 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.93 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.93 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.57 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.62 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.13 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.39 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.04 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.67 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.71 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  41.42 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  33.22 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  31.43 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.46 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  32.37 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  30.36 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  30.36 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  30.36 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  32.37 
 
 		 335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  38.8 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  32.01 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  30.95 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.62 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.22 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  31.9 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  31.9 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  31.9 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.62 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.54 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.57 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  32.22 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.04 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  29.68 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  30.18 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.36 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  29.79 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  30.92 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  30.14 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  31.79 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.71 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  29.39 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  28.67 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.97 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  31.45 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  29.89 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  29.54 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  31.45 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.97 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.97 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.2 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  30.47 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  29.47 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  30.32 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  29.2 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  30.36 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  28.67 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  29.08 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  29.75 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  29.71 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  27.49 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  31.94 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  28.67 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  29.75 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.52 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.52 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.52 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  30.58 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  29.58 
 
 		 308 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  29.97 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.32 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  29.5 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  29.58 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  29.39 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  28.11 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  28.88 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  31.02 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  30.25 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  29.64 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  32.39 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  28.62 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  36.46 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  30.27 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  29.33 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  29.33 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  29.33 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  29.33 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  29.33 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  29.86 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  29.29 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  28.16 
 
 		 309 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>