289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3703 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  64.16 
 
 
275 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.07 
 
 
276 aa  316  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4182  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  53.19 
 
 
281 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.06 
 
 
281 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.06 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.61 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.06 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.29 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.47 
 
 
281 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.24 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  47.33 
 
 
268 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.52 
 
 
278 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.31 
 
 
278 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.04 
 
 
279 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.67 
 
 
277 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2614  dioxygenase, TauD/TfdA family  38.69 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0065019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2354  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.84 
 
 
279 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  0.202809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  33.79 
 
 
295 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  34.98 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  33.33 
 
 
308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  34.17 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.94 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.32 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  32.39 
 
 
276 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  31.46 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  31.67 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  33.56 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.63 
 
 
282 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.69 
 
 
298 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  32.85 
 
 
293 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  29.5 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  29.54 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  31.51 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  32.12 
 
 
300 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  31.21 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.47 
 
 
285 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  32.13 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  29.3 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  31.21 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  29.03 
 
 
298 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  31.52 
 
 
301 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.03 
 
 
301 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  31.9 
 
 
314 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.63 
 
 
305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.63 
 
 
305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  32 
 
 
300 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  32.72 
 
 
272 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.8 
 
 
305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  28.33 
 
 
301 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.89 
 
 
287 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  29.93 
 
 
318 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  38.98 
 
 
301 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  29.33 
 
 
287 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  29.75 
 
 
285 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  31.83 
 
 
299 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  31.67 
 
 
304 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  32.99 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  32.99 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  30.31 
 
 
305 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  32.99 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  32.99 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  31.01 
 
 
295 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  32.99 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  30.82 
 
 
317 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  28.87 
 
 
300 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  31.51 
 
 
299 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  32.49 
 
 
293 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  29.62 
 
 
302 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
317 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  30.94 
 
 
316 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  31.93 
 
 
309 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  32.64 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
318 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
305 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
305 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
305 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  31.51 
 
 
316 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  31.02 
 
 
301 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.32 
 
 
298 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  28.03 
 
 
300 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
305 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  28.42 
 
 
312 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  32.98 
 
 
291 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
317 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  30.82 
 
 
309 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
317 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  30.85 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  30.85 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  31.93 
 
 
322 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  31.12 
 
 
280 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  30.07 
 
 
308 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  30.82 
 
 
317 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.93 
 
 
304 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  31.71 
 
 
282 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
277 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  31.67 
 
 
308 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
335 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  28.47 
 
 
271 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>