99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3131 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  100 
 
 
587 aa  1225    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  27.4 
 
 
661 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1537  pvcA protein  24.83 
 
 
608 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3133  Pyoverdine biosynthesis protein  29.63 
 
 
335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2987  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  32.92 
 
 
328 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2755  pyoverdine biosynthesis protein  28.24 
 
 
270 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0236  hypothetical protein  31.47 
 
 
349 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35430  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  31.69 
 
 
328 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000151483  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.23 
 
 
287 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0236  hypothetical protein  29.74 
 
 
349 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3777  Pyoverdine biosynthesis protein  30.43 
 
 
274 aa  107  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2754  pyoverdine biosynthesis  28.67 
 
 
322 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0229  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30.8 
 
 
353 aa  104  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3224  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.3 
 
 
284 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1924  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30.1 
 
 
352 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1679  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30 
 
 
352 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2201  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30.1 
 
 
352 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.929811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0228  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30 
 
 
352 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1225  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30.1 
 
 
352 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0939  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30.1 
 
 
352 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0318  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30 
 
 
352 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0703  pyoverdine biosynthesis protein  28.26 
 
 
295 aa  97.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.215316 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29841  predicted protein  27.72 
 
 
494 aa  97.1  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0522184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0237  hypothetical protein  26.42 
 
 
278 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02705  conserved hypothetical protein, putative pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein ditA (Eurofung)  26.49 
 
 
664 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.365279 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0237  hypothetical protein  26.42 
 
 
278 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1534  PvcB protein  27.34 
 
 
287 aa  94  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1104  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.41 
 
 
279 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3225  Pyoverdine biosynthesis protein  26.09 
 
 
321 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2908  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.53 
 
 
292 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1103  Pyoverdine biosynthesis protein  26.09 
 
 
321 aa  89  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  26.77 
 
 
304 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.77 
 
 
304 aa  87  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  26.77 
 
 
304 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  27.24 
 
 
303 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2986  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  24.81 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.77 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.77 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.77 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.77 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35420  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  24.35 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00595463  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  37.5 
 
 
306 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1324  hypothetical protein  34.04 
 
 
853 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.995805  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6017  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.93 
 
 
301 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  31 
 
 
302 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  25.56 
 
 
296 aa  50.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  31.48 
 
 
299 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  33.75 
 
 
300 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  27.14 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  32.58 
 
 
308 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.33 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  24.67 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1748  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.41 
 
 
317 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.82 
 
 
345 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.71 
 
 
277 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  33.75 
 
 
300 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0370  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.72 
 
 
325 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.36 
 
 
284 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  32.5 
 
 
301 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  27.81 
 
 
299 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  32.47 
 
 
267 aa  47.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.45 
 
 
345 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.06 
 
 
287 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  26 
 
 
299 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  27.81 
 
 
299 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  30.93 
 
 
308 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  30.93 
 
 
308 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  32.32 
 
 
308 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  34.21 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  32.1 
 
 
299 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  30 
 
 
302 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24 
 
 
336 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  29.29 
 
 
277 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  26.01 
 
 
289 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30 
 
 
282 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  26 
 
 
273 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  26.61 
 
 
295 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  30 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  24.31 
 
 
264 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  31.17 
 
 
264 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  31.25 
 
 
292 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.86 
 
 
304 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  31.31 
 
 
295 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  31.25 
 
 
283 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  31.25 
 
 
283 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  30.34 
 
 
305 aa  44.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  25.15 
 
 
308 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0211  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.85 
 
 
270 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.56 
 
 
288 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1501  hypothetical protein  27.84 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.67 
 
 
339 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  25.69 
 
 
312 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  29.49 
 
 
298 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  32.05 
 
 
308 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  32.05 
 
 
308 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  33.75 
 
 
283 aa  43.9  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.77 
 
 
298 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  30 
 
 
322 aa  43.5  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>