46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3171 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 431 aa  872    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  43.78 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  43.78 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0503  gamma-butyrobetaine hydroxylase  42.71 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  43.51 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4975  gamma-butyrobetaine dioxygenase  42.16 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0616  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  44.05 
 
 		 398 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5234  gamma-butyrobetaine hydroxylase  40.2 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0241569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4455  gamma-butyrobetaine dioxygenase  42.16 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4369  Gamma-butyrobetaine dioxygenase  36.32 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150336  normal  0.374908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  36.77 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0052  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  35.32 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0333  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  31.01 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.561528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2006  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  30.56 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  27.74 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  31.59 
 
 		 407 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2344  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.01 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2204  trimethyllysine dioxygenase  26.48 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20714  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  34.52 
 
 		 555 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  29.21 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.87 
 
 		 371 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33061  Gamma-butyrobetaine dioxygenase (Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase) (Gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Gamma-BBH)  32.64 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1569  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  30.08 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1481  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  30.18 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0070  putative gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.82 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  26.5 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41243  predicted protein  26.06 
 
 		 549 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  26.69 
 
 		 575 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02980  mitochondrion protein, putative  24.59 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.455571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0693  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.53 
 
 		 328 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.358626 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49480  predicted protein  28.73 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1891  hypothetical protein  25.23 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0319  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  26.6 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0229  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  26.6 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1680  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.6 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.36 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2200  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.06 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.744503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1224  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.06 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738229  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0938  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.06 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1923  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcB  26.06 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.07 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  28.07 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0230  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  25.11 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1534  PvcB protein  24.89 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2755  pyoverdine biosynthesis protein  23.08 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.03 
 
 		 279 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>