21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1891 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1891  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.84 
 
 
339 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02110  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9632  hypothetical protein  28.19 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1809  hypothetical protein  30.77 
 
 
363 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  28.21 
 
 
342 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09375  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06453  TfdA family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13850)  26.51 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04198  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.382826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.23 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3125  hypothetical protein  24.1 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3124  hypothetical protein  21.88 
 
 
375 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48620  putative clavaminic acid synthetase  25.73 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00225016  normal  0.0158696 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03910  mitochondrion protein, putative  23.53 
 
 
575 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.23 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03180  conserved hypothetical protein  22.57 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0157226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1652  putative taurine catabolism dioxygenase  28.14 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.98 
 
 
408 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  27.09 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07568  Gamma-butyrobetaine hydroxylase subfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14970)  26.09 
 
 
555 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516826  normal  0.240126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>