15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3125 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3125  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  763    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3124  hypothetical protein  60.66 
 
 
375 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9632  hypothetical protein  29.66 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.25 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  27.71 
 
 
342 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09375  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 
399 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1809  hypothetical protein  27.8 
 
 
363 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02110  conserved hypothetical protein  23.63 
 
 
399 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04198  conserved hypothetical protein  23.51 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.382826 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06453  TfdA family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13850)  20.78 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03180  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0157226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1891  hypothetical protein  24.1 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48620  putative clavaminic acid synthetase  23.32 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00225016  normal  0.0158696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.04 
 
 
286 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1989  hypothetical protein  24.36 
 
 
251 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.123157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>