21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0577 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 339 aa  702    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02110  conserved hypothetical protein  37.69 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  38.11 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09375  conserved hypothetical protein  35.65 
 
 		 399 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9632  hypothetical protein  36.73 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1809  hypothetical protein  36.84 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1891  hypothetical protein  30.84 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3124  hypothetical protein  25.15 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04198  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.382826 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06453  TfdA family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13850)  28.53 
 
 		 377 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3125  hypothetical protein  25.25 
 
 		 368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03180  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0157226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48620  putative clavaminic acid synthetase  27.78 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00225016  normal  0.0158696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.4 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2770  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  28.48 
 
 		 408 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.708275  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46425  Trimethyllysine dioxygenase (Epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase) (TML-alpha-ketoglutarate dioxygenase) (TML hydroxylase) (TML dioxygenase) (TMLD)  25.17 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1989  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2242  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.06 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  27.39 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3320  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.99 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5047  gamma-butyrobetaine dioxygenase  25.99 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.797229  normal  0.931237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>