16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1809 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  720    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.55 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9632  hypothetical protein  33.69 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  32.78 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1891  hypothetical protein  30.26 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3124  hypothetical protein  24.4 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02110  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09375  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48620  putative clavaminic acid synthetase  33.77 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00225016  normal  0.0158696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3125  hypothetical protein  26.53 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.1 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04198  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.382826 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06453  TfdA family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13850)  25.67 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03180  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0157226  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 		 487 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2242  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.7 
 
 		 271 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>