16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2242 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2242  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 271 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3719  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  58.8 
 
 		 289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0650  hypothetical protein  27.47 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.240034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2451  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.75 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.73 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2491  hypothetical protein  31.1 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.876184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1283  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.89 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9632  hypothetical protein  27.61 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5179  hypothetical protein  25.67 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.06 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09375  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2184  taurine catabolism dioxygenase  25.4 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.415613  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02110  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1809  hypothetical protein  25.7 
 
 		 363 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  21.76 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>