19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9632 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9632  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0577  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.73 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1809  hypothetical protein  33.69 
 
 		 363 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26795  predicted protein  32.78 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0765351  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3124  hypothetical protein  31.14 
 
 		 375 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02110  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1891  hypothetical protein  28.19 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.923988 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09375  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3125  hypothetical protein  29.66 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48620  putative clavaminic acid synthetase  31.27 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00225016  normal  0.0158696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2233  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.08 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00105425  normal  0.113203 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04198  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.382826 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06453  TfdA family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13850)  27.24 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03180  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0157226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1989  hypothetical protein  24.88 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2242  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.61 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6146  hypothetical protein  26.85 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.600934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0614  hypothetical protein  27.8 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5237  gamma-butyrobetaine dioxygenase  28.29 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>