18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  100 
 
 		 327 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  31.18 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  29.96 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  33.21 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  31.47 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  30.65 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  30.27 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  28.87 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  26.96 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  25.55 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  24.51 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3169  hypothetical protein  25.09 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1584  hypothetical protein  26.21 
 
 		 225 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214695  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2834  hypothetical protein  25.09 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.287592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  25.6 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>