16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1042 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  100 
 
 		 354 aa  715    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  31.27 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  32.69 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  30.65 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  31.97 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  33.05 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  29.43 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  27.6 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  28.08 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  28.95 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  28.95 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  28.95 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  26.17 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  24.32 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0852  hypothetical protein  37.31 
 
 		 184 aa  46.2  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1584  hypothetical protein  26.29 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214695  normal  0.720005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>