14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5877 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  753    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  98.66 
 
 
373 aa  742    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  33.08 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  29.38 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  28.95 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  27.63 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  26.61 
 
 
316 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  27.05 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  27.35 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  26.52 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  25.28 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  25.29 
 
 
340 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  29.29 
 
 
343 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>