18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3958 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  100 
 
 		 331 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  52.45 
 
 		 358 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  32.38 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  33.91 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  32.66 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  31.8 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  31.91 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  30.95 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  26.98 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  25.69 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  23.68 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  27.63 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  27.63 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  27.35 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3169  hypothetical protein  25.63 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2834  hypothetical protein  25.88 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.287592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0540  gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase  29.19 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4753  hypothetical protein  26.88 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>