16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0540 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  38.91 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  27 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  25.49 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  23.81 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  28.32 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1456  hypothetical protein  24.44 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4753  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  24.9 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  23.81 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  25.69 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  25.91 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  25.91 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  24.32 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  26.64 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3171  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.71 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>