18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5419 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  32.81 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  26.53 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2834  hypothetical protein  25.78 
 
 		 382 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.287592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  27.57 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  26.96 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  27.85 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  25.54 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3169  hypothetical protein  23.19 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  26.98 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  26.83 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  23.42 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  25.69 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  26.52 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4753  hypothetical protein  18.75 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  26.52 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  26.52 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1584  hypothetical protein  25.58 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214695  normal  0.720005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>