14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3456 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  38.66 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  34.3 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  26.53 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  31.8 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3169  hypothetical protein  24.44 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2834  hypothetical protein  24.44 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.287592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  28.87 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  28.09 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  28.62 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  28.08 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  29.29 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  29.29 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  29.29 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>