17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1155 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3456  hypothetical protein  38.66 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226272  hitchhiker  0.00000199122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  32.81 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  39.26 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  33.91 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  32.67 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3169  hypothetical protein  26.33 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  30.27 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2834  hypothetical protein  27.85 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.287592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  29.43 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  31.09 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  23.44 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  26.61 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  26.61 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  26.61 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4753  hypothetical protein  26.52 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  23.81 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>