14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1305 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1305  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  702    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0540  hypothetical protein  38.91 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6328  oxygenase (secreted protein)  24.91 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0712718  normal  0.0105012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0231  clavaminate synthase  25 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0669092  normal  0.226124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3958  clavaminate synthase  25.69 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1155  hypothetical protein  23.44 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33410  Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family  25.55 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4753  hypothetical protein  25.17 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5419  hypothetical protein  23.42 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3755  hypothetical protein  25.4 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00308537  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1042  oxygenase (secreted protein)  26.17 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5513  hypothetical protein  25.29 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5877  hypothetical protein  25.29 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6386  hypothetical protein  25.29 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  0.430916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>