122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00740 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG00740  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.620803  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00230  cytoplasm protein, putative  56.92 
 
 		 404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.923309  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07164  conserved hypothetical protein  50.37 
 
 		 534 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.750517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1061  UbiD family decarboxylase  37.01 
 
 		 490 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03130  hypothetical protein  32.76 
 
 		 496 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456307  hitchhiker  0.000000178066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3657  UbiD family decarboxylase  37.84 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.072913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0338  hypothetical protein  29.7 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1073  UbiD family decarboxylase  35.14 
 
 		 495 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0961197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.04 
 
 		 501 aa  55.1  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.43 
 
 		 498 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.43 
 
 		 495 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.43 
 
 		 506 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 492 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 492 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 492 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.63 
 
 		 502 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  32.63 
 
 		 502 aa  51.6  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.1 
 
 		 497 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.13 
 
 		 492 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.13 
 
 		 492 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.63 
 
 		 506 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  30.53 
 
 		 502 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  26.61 
 
 		 463 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  32.63 
 
 		 504 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  30.53 
 
 		 502 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  30.53 
 
 		 502 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  29.51 
 
 		 491 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.81 
 
 		 522 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  29.91 
 
 		 488 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  30.77 
 
 		 498 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  29.81 
 
 		 488 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  29.81 
 
 		 488 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.07 
 
 		 497 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  29.13 
 
 		 488 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.43 
 
 		 487 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.13 
 
 		 498 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.42 
 
 		 520 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  26.88 
 
 		 482 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  29.13 
 
 		 493 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  27.73 
 
 		 481 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.13 
 
 		 498 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  29.47 
 
 		 479 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.85 
 
 		 550 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4166  Carboxylyase-related protein  32.77 
 
 		 498 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  28.16 
 
 		 498 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  26.21 
 
 		 488 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.85 
 
 		 488 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  28.85 
 
 		 488 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  28.83 
 
 		 498 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.57 
 
 		 502 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  30.1 
 
 		 493 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  28.85 
 
 		 488 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.42 
 
 		 520 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1323  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  28.57 
 
 		 649 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  30.1 
 
 		 493 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  42 
 
 		 525 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  30.69 
 
 		 469 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  27.18 
 
 		 487 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2127  Carboxylyase-related protein  31.73 
 
 		 532 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  27.1 
 
 		 512 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40 
 
 		 525 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38 
 
 		 509 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8148  Carboxylyase-related protein  37.93 
 
 		 565 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.733073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  39.58 
 
 		 492 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  28.04 
 
 		 487 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.58 
 
 		 488 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.1 
 
 		 507 aa  44.7  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0437  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  24.24 
 
 		 471 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.18 
 
 		 488 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0993  carboxylyase-like protein  26.36 
 
 		 612 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0931103  normal  0.250406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0938  carboxylyase-like protein  27.59 
 
 		 626 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.47 
 
 		 521 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  28.16 
 
 		 493 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  29.13 
 
 		 493 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  28.04 
 
 		 487 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.13 
 
 		 506 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  26.28 
 
 		 461 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  26.76 
 
 		 496 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  28.16 
 
 		 488 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3173  Carboxylyase-related protein  28.57 
 
 		 624 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.546258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  27.37 
 
 		 520 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.18 
 
 		 490 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.16 
 
 		 493 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.16 
 
 		 493 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.16 
 
 		 493 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>