More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3179 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3179  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.825249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
259 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.05 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 
257 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.03 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.56 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2750  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
262 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
282 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
261 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.42 
 
 
280 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.23 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  26.36 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
265 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 
263 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
263 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.03 
 
 
264 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  31.77 
 
 
296 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.56 
 
 
261 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
263 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
263 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
259 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 
259 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
273 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
256 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
259 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0786  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
262 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
254 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
262 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 
251 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 
258 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 
253 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 
266 aa  105  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  34.97 
 
 
267 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4396  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
262 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000474445  hitchhiker  2.81205e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.36 
 
 
251 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
282 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0935  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
262 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.220694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
261 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1071  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0979  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0848  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0791  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0796  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 
263 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
291 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0894  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
270 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0721  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
262 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.834071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0979  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.02824e-22 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 
263 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
270 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 
264 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
263 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
265 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
297 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
264 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
288 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.58 
 
 
261 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
264 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
269 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  29.03 
 
 
264 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
276 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 
267 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
261 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
265 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 
258 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
259 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.15 
 
 
262 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
270 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  29.07 
 
 
263 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
296 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
264 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>