161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0739 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0739  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00356528  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0715  ABC transporter ATPase  51.2 
 
 
254 aa  236  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0689546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  49.21 
 
 
253 aa  224  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  48.82 
 
 
253 aa  224  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  48.82 
 
 
253 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0079  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.895882  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0468  AAA ATPase family protein  46.15 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  42.02 
 
 
292 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  37.31 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  45.25 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  41.06 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  41.67 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  41.18 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  40.94 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  40.94 
 
 
348 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  40.94 
 
 
295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  40.55 
 
 
295 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  40.4 
 
 
290 aa  175  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  39.06 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  38.67 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  39.22 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  39.52 
 
 
318 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  38.04 
 
 
296 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  38.98 
 
 
296 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  37.25 
 
 
295 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  38.43 
 
 
296 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  38.68 
 
 
288 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  38.02 
 
 
283 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  40.6 
 
 
325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  36.86 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  38.82 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  40.77 
 
 
291 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  37.16 
 
 
287 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  37.16 
 
 
287 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  42.13 
 
 
306 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  38.7 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  39.15 
 
 
292 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  38.55 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  36.11 
 
 
294 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  39.13 
 
 
278 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  39.34 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  37.96 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  38.7 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  40.09 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  38.7 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  39.15 
 
 
292 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  37.5 
 
 
291 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  38.82 
 
 
296 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  37.05 
 
 
293 aa  161  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  39.32 
 
 
329 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  37.3 
 
 
292 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  36.65 
 
 
291 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  37.3 
 
 
292 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  38.72 
 
 
298 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  39.66 
 
 
324 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  39.74 
 
 
335 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  36.22 
 
 
300 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  34.9 
 
 
294 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  38.53 
 
 
304 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  37.77 
 
 
296 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  35.51 
 
 
303 aa  158  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  38.25 
 
 
289 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  35.86 
 
 
300 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  37.13 
 
 
295 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  35.69 
 
 
296 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  38.89 
 
 
323 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  38.77 
 
 
430 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  37.83 
 
 
280 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  37.55 
 
 
294 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1465  protein of unknown function DUF815  34.87 
 
 
273 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000978175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  38.17 
 
 
289 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  37.96 
 
 
294 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  36.33 
 
 
297 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  34.51 
 
 
294 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  35.51 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  36.06 
 
 
297 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  37.01 
 
 
285 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  34.65 
 
 
296 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  37.3 
 
 
289 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  38.25 
 
 
289 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  38.2 
 
 
290 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  37.85 
 
 
289 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  37.45 
 
 
296 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  37.45 
 
 
299 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  36.91 
 
 
296 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  36.91 
 
 
296 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  37.18 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  37.85 
 
 
289 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  38.25 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  37.85 
 
 
289 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  38.25 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  36.29 
 
 
325 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  35.69 
 
 
299 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  36.73 
 
 
294 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  36.48 
 
 
291 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  37.96 
 
 
303 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  38.86 
 
 
291 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1039  protein of unknown function DUF815  35.39 
 
 
296 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  39.73 
 
 
299 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>