More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2216 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2216  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.641494  normal  0.0180318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1981  response regulator receiver domain protein(CheY)  77.97 
 
 		 59 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 776 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.5 
 
 		 582 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 776 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 835 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1352 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  30.33 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  36.27 
 
 		 659 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 869 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1057 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  36.45 
 
 		 755 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1287 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 807 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  35.58 
 
 		 584 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 572 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  33.6 
 
 		 2458 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1099 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1406 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  33.6 
 
 		 2476 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0067  histidine kinase  32.74 
 
 		 486 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  41.84 
 
 		 524 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  34.45 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  34.55 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.46 
 
 		 1152 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 641 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 		 2336 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 730 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  31.73 
 
 		 742 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  31.67 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  30.83 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.34 
 
 		 1303 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1629 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.12 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 2539 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  32.77 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  31.03 
 
 		 2284 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 760 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  33.64 
 
 		 248 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  34.17 
 
 		 247 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 246 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 273 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.1 
 
 		 1987 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 2423 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.45 
 
 		 739 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 232 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 230 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 248 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 230 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 237 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 230 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.96 
 
 		 1453 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 938 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1646 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  34.19 
 
 		 647 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 866 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  33.05 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 1646 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 664 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 592 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.57 
 
 		 1992 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.19 
 
 		 619 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  30.17 
 
 		 2301 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 816 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  33.88 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  33.64 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.21 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  37.86 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  39.05 
 
 		 741 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 503 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  31.25 
 
 		 800 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1692 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 568 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>