14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1981 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1981  response regulator receiver domain protein(CheY)  100 
 
 		 59 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2216  response regulator receiver domain-containing protein  77.97 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.641494  normal  0.0180318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  43.75 
 
 		 659 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  41.86 
 
 		 524 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 869 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 526 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 776 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.67 
 
 		 660 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.09 
 
 		 1453 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 623 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 776 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 776 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 529 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 		 1406 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>