More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6695 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6695  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5440  transcriptional regulator, LysR family  54.17 
 
 		 295 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2784  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.551315 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5829  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0302326  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  35.93 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2413  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 323 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4353  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3530  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  36.58 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  32.99 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  37.92 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5031  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  36.64 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.84 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.4 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5252  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.14 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6056  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18637  normal  0.867565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0591  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5692  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>