More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4106 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4106  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 176 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 193 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.09 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 176 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.81 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  43.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  48.65 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  43.57 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  42.07 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  42.36 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  40 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  42.47 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  42.55 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.12 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  43.66 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  41.13 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  41.3 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  39.19 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  41.96 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  39.72 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  38.36 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  39.01 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  38.03 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  36.67 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.84 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  40.54 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  38.93 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  40.88 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  40.14 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  42.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  46.97 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  41.18 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  42.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  42.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  43.07 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  42.18 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  40.69 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  39.73 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  36.49 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  43.8 
 
 		 147 aa  120  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  42.66 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  42.18 
 
 		 191 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  38.03 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  41.5 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>