45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7158 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  100 
 
 		 1056 aa  2142    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1076 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  31.67 
 
 		 1313 aa  193  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  28.3 
 
 		 1339 aa  181  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  30.78 
 
 		 1283 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1206 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1201 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  31 
 
 		 1290 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  29.11 
 
 		 1297 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.22 
 
 		 1284 aa  160  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  29.72 
 
 		 1285 aa  156  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  28.26 
 
 		 1263 aa  156  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  27.22 
 
 		 996 aa  155  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  28.29 
 
 		 1300 aa  148  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  28.38 
 
 		 1301 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  28.6 
 
 		 1301 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  27.94 
 
 		 1301 aa  138  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  40.78 
 
 		 742 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  42.27 
 
 		 1296 aa  132  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  25.96 
 
 		 1296 aa  131  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  26.18 
 
 		 1296 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  30.95 
 
 		 1280 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1306 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1305 aa  128  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  27.2 
 
 		 1300 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  27.2 
 
 		 1300 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  27.2 
 
 		 1300 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  36.88 
 
 		 1279 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1111 aa  125  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  36.74 
 
 		 734 aa  124  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1117 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1483 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1297 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.23 
 
 		 1300 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  26.59 
 
 		 1286 aa  113  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  39.89 
 
 		 1252 aa  112  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  35.94 
 
 		 1302 aa  112  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1287 aa  107  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.95 
 
 		 1302 aa  104  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.49 
 
 		 1302 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  25 
 
 		 1124 aa  90.1  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  25 
 
 		 1124 aa  90.1  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2724  putative phage associated protein  27.04 
 
 		 703 aa  79.3  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000314154  normal  0.0508963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3058  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  30.03 
 
 		 711 aa  74.7  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  27.42 
 
 		 215 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>