43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1990 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  100 
 
 
742 aa  1433    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  39.81 
 
 
734 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  44.13 
 
 
1117 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  42.13 
 
 
1339 aa  141  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.56 
 
 
1279 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.92 
 
 
1300 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  41.99 
 
 
1283 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  46.54 
 
 
1252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  40.1 
 
 
1483 aa  135  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  37.62 
 
 
1111 aa  134  9e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  41.26 
 
 
1296 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  42.06 
 
 
1286 aa  130  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  39.9 
 
 
1305 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  38.7 
 
 
1287 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  40.38 
 
 
1300 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  39.35 
 
 
1302 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.21 
 
 
1285 aa  124  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  42.65 
 
 
1297 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  41.58 
 
 
1056 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  39.36 
 
 
1297 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  33.33 
 
 
1206 aa  120  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  41.99 
 
 
1313 aa  120  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  41.71 
 
 
1301 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  42.18 
 
 
1301 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.92 
 
 
1290 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  40.43 
 
 
1296 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  41.71 
 
 
1300 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  41.71 
 
 
1300 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  41.71 
 
 
1300 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  39.89 
 
 
1296 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  42.52 
 
 
1280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  38.76 
 
 
1263 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  38.03 
 
 
1302 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  38.03 
 
 
1302 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  45.12 
 
 
1301 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  34.52 
 
 
1201 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  41.27 
 
 
1284 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  35.89 
 
 
1306 aa  101  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  35.33 
 
 
1076 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  30.68 
 
 
996 aa  79.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  37.18 
 
 
215 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  30.86 
 
 
1124 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  31.78 
 
 
1124 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>