47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1089 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  46.12 
 
 		 1300 aa  963    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  79.26 
 
 		 1296 aa  2028    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 1297 aa  2590    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  45.78 
 
 		 1117 aa  888    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  46.07 
 
 		 1301 aa  959    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  40.87 
 
 		 1287 aa  832    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  45.16 
 
 		 1286 aa  974    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.17 
 
 		 1300 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  55.88 
 
 		 1305 aa  1398    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  43.71 
 
 		 996 aa  735    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  38.96 
 
 		 1302 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  39.29 
 
 		 1302 aa  736    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.17 
 
 		 1279 aa  920    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  40.6 
 
 		 1302 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  45.35 
 
 		 1301 aa  906    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  40.85 
 
 		 1290 aa  830    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  39.39 
 
 		 1300 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  42.85 
 
 		 1280 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  40.61 
 
 		 1263 aa  846    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  42.81 
 
 		 1313 aa  899    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.57 
 
 		 1285 aa  940    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  80.03 
 
 		 1296 aa  2038    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  42.9 
 
 		 1297 aa  898    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  45.81 
 
 		 1300 aa  957    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  45.97 
 
 		 1300 aa  958    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  57.17 
 
 		 1483 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  42.99 
 
 		 1283 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  43 
 
 		 1284 aa  912    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  56.85 
 
 		 1306 aa  1421    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  47.26 
 
 		 1301 aa  970    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  43.26 
 
 		 1252 aa  835    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  41.9 
 
 		 1339 aa  925    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  58.41 
 
 		 1296 aa  1431    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1206 aa  461  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1201 aa  452  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1111 aa  447  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  36.22 
 
 		 752 aa  320  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  35.25 
 
 		 754 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  40 
 
 		 734 aa  138  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  40.48 
 
 		 742 aa  133  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1056 aa  119  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1076 aa  115  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  36.68 
 
 		 215 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1124 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1124 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2724  putative phage associated protein  36.28 
 
 		 703 aa  51.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000314154  normal  0.0508963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0569  hypothetical protein  23.01 
 
 		 931 aa  46.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000706719  unclonable  6.43821e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>