47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3901 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  47.19 
 
 
1300 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  43.95 
 
 
1296 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  44.45 
 
 
1297 aa  910    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  47.46 
 
 
1117 aa  874    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  46.57 
 
 
1301 aa  935    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  42.59 
 
 
1287 aa  852    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  45.17 
 
 
1286 aa  895    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  46.83 
 
 
1300 aa  948    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  41.78 
 
 
1305 aa  902    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  46.11 
 
 
996 aa  736    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  41.95 
 
 
1302 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  41.74 
 
 
1302 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  100 
 
 
1279 aa  2501    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.13 
 
 
1302 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  46.12 
 
 
1301 aa  923    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  43.15 
 
 
1290 aa  808    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.19 
 
 
1300 aa  764    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  45.37 
 
 
1280 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  43.99 
 
 
1263 aa  873    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  45.33 
 
 
1313 aa  947    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.33 
 
 
1285 aa  917    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  44.03 
 
 
1296 aa  903    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  43.44 
 
 
1297 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  47.27 
 
 
1300 aa  965    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  47.27 
 
 
1300 aa  964    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  43.81 
 
 
1283 aa  882    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.97 
 
 
1284 aa  927    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  44.05 
 
 
1306 aa  921    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  46.97 
 
 
1301 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  46.74 
 
 
1252 aa  903    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  43.26 
 
 
1339 aa  884    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  42.81 
 
 
1296 aa  865    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  49.68 
 
 
1483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  24.87 
 
 
1206 aa  486  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  24.24 
 
 
1201 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  29.55 
 
 
1111 aa  421  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  33.74 
 
 
754 aa  293  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  33.23 
 
 
752 aa  276  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  48.99 
 
 
734 aa  165  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  42.56 
 
 
742 aa  141  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  42.86 
 
 
215 aa  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  35.54 
 
 
1056 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  26.44 
 
 
1076 aa  107  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  29.46 
 
 
1124 aa  87.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  29.46 
 
 
1124 aa  87  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0569  hypothetical protein  24.6 
 
 
931 aa  60.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000706719  unclonable  6.43821e-20 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3058  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  25.17 
 
 
711 aa  50.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>