47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1692 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  41.54 
 
 
1301 aa  769    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  38.93 
 
 
1297 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  40.77 
 
 
1117 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  41.94 
 
 
1300 aa  779    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  43.93 
 
 
1287 aa  867    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  45.22 
 
 
1286 aa  880    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  46.17 
 
 
1300 aa  998    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  38.8 
 
 
1305 aa  772    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  41.75 
 
 
1301 aa  779    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  38.61 
 
 
1296 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  95.7 
 
 
1302 aa  2347    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.71 
 
 
1279 aa  784    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  65.32 
 
 
1302 aa  1546    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  41.86 
 
 
1301 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  41.79 
 
 
1300 aa  774    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  100 
 
 
1302 aa  2532    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  49.01 
 
 
1290 aa  983    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  86.24 
 
 
1300 aa  2083    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  40.68 
 
 
1313 aa  817    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  39.86 
 
 
1296 aa  744    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  38.97 
 
 
1339 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  39.66 
 
 
1252 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  41.79 
 
 
1300 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  41.15 
 
 
1306 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  49.96 
 
 
1284 aa  1065    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  49.77 
 
 
1283 aa  1075    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  48.85 
 
 
1280 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  48.71 
 
 
1285 aa  1043    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  38.91 
 
 
1296 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  40.56 
 
 
1263 aa  816    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  50.93 
 
 
1297 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  40.04 
 
 
996 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  27.55 
 
 
1111 aa  459  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  44.36 
 
 
1483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  24.39 
 
 
1201 aa  445  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  24.07 
 
 
1206 aa  442  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  32.05 
 
 
752 aa  249  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  29.61 
 
 
754 aa  222  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  37.06 
 
 
734 aa  136  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  40.85 
 
 
742 aa  129  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  27.66 
 
 
1076 aa  124  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  26.12 
 
 
1056 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  36.41 
 
 
215 aa  93.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  25.32 
 
 
1124 aa  66.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  25.32 
 
 
1124 aa  64.3  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0569  hypothetical protein  26.39 
 
 
931 aa  57.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000706719  unclonable  6.43821e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2724  putative phage associated protein  27.02 
 
 
703 aa  48.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000314154  normal  0.0508963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>