38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3718 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  70.7 
 
 
996 aa  298  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  58.6 
 
 
1339 aa  243  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  51.17 
 
 
1301 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  49.77 
 
 
1300 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  49.77 
 
 
1300 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  49.77 
 
 
1300 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  49.53 
 
 
1301 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  48.34 
 
 
1301 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  46.05 
 
 
1286 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  40.47 
 
 
1284 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  39.52 
 
 
1285 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  40.78 
 
 
1280 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  41.4 
 
 
1313 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  42.86 
 
 
1283 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  38.92 
 
 
1306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  43.26 
 
 
1297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  42.86 
 
 
1279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  40.28 
 
 
1290 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  33.65 
 
 
1483 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  36.18 
 
 
1296 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  35.94 
 
 
1263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  35.68 
 
 
1296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  36.68 
 
 
1297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  37.37 
 
 
1300 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  35.27 
 
 
1305 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  35.33 
 
 
1287 aa  101  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  37.07 
 
 
1300 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  36.96 
 
 
1302 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  36.41 
 
 
1302 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  33.02 
 
 
1252 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  33.49 
 
 
1076 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  29.41 
 
 
1296 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  34.62 
 
 
1302 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  29.33 
 
 
1206 aa  65.9  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  27.75 
 
 
1201 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  27.42 
 
 
1056 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  35.06 
 
 
742 aa  51.6  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>